煤矸石是煤炭生产过程中的主要废弃物，传统的方式是直接排至地面。在造成污染后再进行治理，既没有经济效益，也没有环境效益。因此在治理矸石问题上，既要采取从源头抓起的处理方式，实施清洁生产，又要搞好综合治理、保护环境，并最大限度地利用矿产资源，走良性发展的道路。
1 减少井下矸石产生量
矸石不出井，不但可减少矸石占地、降低运输成本，而且可减轻对环境的污染，具有较好的经济效益和社会效益。在巷道设计、施工工艺设计、矸石运转和井下充填等多个环节，要充分考虑矸石的井下处理，从源头上减少矸石的出井量，从而减少地面堆积的数量，降低地面处理的工作量。
1） 改进设计方式
随着“高产、高效、高安全”矿井的发展建设，采掘速度加快，生产高度集中，矿井或开采层面的服务年限相应缩短，巷道支护技术在不断提高，支护材料逐步改进，开拓巷道可采用全煤巷开拓方式，不必在岩层中开拓。国外如德国、英国近年来已逐渐向全煤巷开拓发展，一些煤矿已取消了排矸系统，我国一些小煤矿也基本无岩石巷道。
2） 巷道矸石处理
在巷道施工过程中，对于半煤岩巷可采用巷旁存矸或宽巷留矸等措施。按照巷道位置和使用条件，在满足生产需求的前提下，以减少矸量为目的，在巷道煤体内掘出相应的矸石硐，用以存放矸石，或加大巷道断面，形成沿巷全长的矸石墙。对于全岩巷道，由于成本较高，一般采用井下不同地点处理矸石的方式，即将矸石存放在预留的采空区或废弃巷道内；或设专门的存放地点，即在掘进巷道附近或其它煤体内，根据所采矸石体积，在不影响采掘及巷道维护的情况下，提前采出或部分采出煤炭，形成一定空间后用以堆放矸石。
2 煤矸石自燃的防治
煤矸石自燃后，会直接向大气排放有害气体，是矿区环境治理的一个重要方面。
熄灭矸石自燃一般有清除燃料、降温、隔氧等途径，采用的方法有挖掘熄灭法、表面封闭法（覆盖法）、喷浆法、灌注法、深部注浆、推平压实等。各地可根据具体的特点和情况，在坚持“以防为主，标本兼治，科学治理”的原则下，因地制宜地采用治理方法。
许多资料和研究表明，圆锥的堆放方式最易自燃。煤矸石以圆锥方式堆放时，大块矸石在底部细小矸石在顶部，自下而上形成许多空隙和曲折通道，为矸石自燃提供了氧分和水分通道，故极易引起自燃。防治的方法是，将矸石粉碎后再堆放，并加以夯实，用黄土或污泥覆盖等方法，搞好矸石山的覆盖。也可以采用石灰乳灭火，利用石灰中所含的CaO在遇水后生成的Ca（OH）2与煤矸石自燃产生的SO2SO3CO2等有害气体生成不溶于水的CaSO4、CaSO3、CaCO3 等。而且在高温下，NaOH能与矸石中的AI2O3、Fe2O3等形成的胶体状物质同前述的盐类形成一层教致密的隔氧层，达到灭火的目的。通过覆盖，一方面减少矸石的透气性供氧量），另一方面可防止煤矸石自燃后的蔓延扩大；同时又能为造林、造田、美化环境创造基础条件。
3 矸石山绿化
矸石山经过绿化后，能防止其大范围的燃烧，从而有效遏制对环境的污染，并能美化矿区环境。通过用黄土覆盖等人为因素改善植物的生长环境待根据复垦场地的条件，选择各种抗限制因子的植被，如刺槐、沙棘等植被，创造出绿色环境。由于草木的成活，涵养了水分，创造了草本植物和菌类生物的成活环境，从而形成较好的微生态环境，绿色植被抑制了扬尘，减少了淋溶水，改善了大气环境与水环境。这些措施在许多矿区都有成熟的经验。
4煤矸石的卫生填埋
卫生填埋是世界上最常用的固体废料处理技术，它是在科学选址的基础上采用必要的场地防护手合理填埋结构以最大程度地减缓和消除固体废料对环境的污染。经过对煤矸石的卫生填埋，能有效地控制淋溶水的扩散，减小对地下水的污染。而且在其顶部防渗层可植树种草，进行土地复垦，恢复生态环境。
